การหยุดฮอร์โมนทดแทน (HRT) เป็นการตัดสินใจที่ผู้หญิงที่ใช้ฮอร์โมนทดแทนเกือบทุกคนต้องเจอในสักวัน ไม่ว่าจะเป็นเพราะอาการดีขึ้นแล้ว ปัจจัยเสี่ยงส่วนตัวเปลี่ยนไป หรือเพียงเพราะใช้มาเป็นระยะเวลาหนึ่งแล้วถึงเวลาทบทวนใหม่ ไม่มีระยะเวลาที่ตายตัวว่าควรใช้นานเท่าไหร่สำหรับทุกคน ระยะเวลาที่เหมาะสมควรเป็นการพูดคุยกับแพทย์เป็นระยะ ไม่ใช่การตัดสินใจเพียงครั้งเดียวตอนเริ่มใช้
การหยุดสามารถทำได้แบบค่อยเป็นค่อยไป โดยลดขนาดยาลงทีละน้อยในช่วงหลายสัปดาห์ถึงหลายเดือน หรือหยุดทันที ซึ่งวิธีที่เลือกส่งผลต่อสิ่งที่ตามมามากกว่าที่หลายคนคิด การลดยาแบบค่อยเป็นค่อยไปมักทำให้อาการต่าง ๆ เช่น ร้อนวูบวาบ เหงื่อออกตอนกลางคืน หรือการนอนหลับที่ถูกรบกวน กลับมาแบบกระจายออกไปในช่วงเวลาที่นานขึ้น ซึ่งบางคนพบว่าจัดการได้ง่ายกว่าในชีวิตประจำวัน ส่วนการหยุดทันทีอาจทำให้อาการกลับมาชัดเจนกว่า แม้ว่าในผู้หญิงบางคนจะแทบไม่ต่างกันเลยก็ตาม เพราะการตอบสนองของแต่ละคนแตกต่างกัน
อีกสิ่งที่ควรทราบคือ การที่อาการกลับมาหลังหยุดยาไม่ได้แปลว่าการรักษา "ล้มเหลว" หรือมีอะไรผิดปกติ โดยทั่วไปหมายความเพียงว่าการเปลี่ยนแปลงของฮอร์โมนตามธรรมชาติในวัยหมดประจำเดือนยังคงอยู่ เมื่อฮอร์โมนที่เสริมเข้าไปถูกถอนออก ส่วนจะกลับมาใช้ยาใหม่ ลดขนาดยาลง เปลี่ยนไปใช้ฮอร์โมนเฉพาะที่ (ทางช่องคลอด) สำหรับอาการแห้งและปัสสาวะเท่านั้น หรือเลือกวิธีที่ไม่ใช้ฮอร์โมนแทน เป็นการตัดสินใจที่ควรทบทวนร่วมกับแพทย์ ไม่ใช่การหาคำตอบเองจากคำแนะนำทั่วไป
ไม่มีช่วงเวลาที่ "ถูกต้อง" เพียงหนึ่งเดียวสำหรับการหยุดยาที่ใช้ได้กับทุกคน จุดที่เหมาะสมขึ้นอยู่กับเหตุผลที่เริ่มใช้ฮอร์โมนทดแทนตั้งแต่แรก อาการในปัจจุบัน และประวัติสุขภาพส่วนตัวหรือของครอบครัวที่เปลี่ยนไปตั้งแต่เริ่มใช้ยา
ควรพบแพทย์ก่อนหยุดฮอร์โมนทดแทนด้วยตัวเอง หากอาการกลับมารบกวนชีวิตประจำวันหลังหยุดยา หรือหากไม่ได้ทบทวนแผนการใช้ฮอร์โมนมานานกว่าหนึ่งปี